ГКУ ЦСА имени Е.П.Глинки создано на основании приказа Комитета социальной защиты населения Москвы от 3 сентября 1996 года за номером №213 наименование учреждения при создании звучало как- "Дом ночного пребывания "Люблино"" Комитета социальной защиты Москвы. Учреждение поставлено на учет с 9 октября 1996 года ИФНС №23 по г. Москве. ОГРН 1037739518200.
Положение об учреждении утверждено приказом Комитета социальной защиты Москвы и зарегистрировано московской регистрационной палатой от 14 февраля 2000 года за номером №950025
ГКУ ЦСА "Люблино" было переименовано в ГКУ ЦСА имени Е.П.Глинки приказом Департамента труда и социальной защиты населения г.Москвы №92 от 06.02.2017г.
На данный момент действует Устав, утвержденный руководителем Департамента труда и социальной защиты населения г. Москвы №92 от 06 февраля 2017 года.